多层次先导化合物优化 第一层次 超大规模分子对接(数量 几亿;速度 0.1-1秒) 第二层次 能量最小化和MM-GB/SA重打分(数量 几万;速度 分钟) 第三层次 基于分子动力学的MM-PB/SA自由能计算(数量 几千;速度 小时到天) 第四层次 自由能微扰(FEP)/热力学积分(Ti),以及伞形抽样(PMF)自由能计算(数量 几百;速度 几天)